In der Anime-Serie zu Guardians of the Galaxy sieht sich die Truppe mit einem seltenen Artefakt konfrontiert, welchen nur auf die DNS von Peter Quill reagiert und eine Schatzkarte enthält, die zu einer mächtigen Waffe führt, bekannt als "Cosmic Seed". Das Cosmic Seed könnte das nächste Universum hervorbringen. Die Guardians müssen das Cosmic Seed finden und letztendlich zerstören, um es vor dem Zugriff diverser Schurken zu schützen, die dessen Macht missbrauchen würden. Dazu gehören Thanos, der Collector, ein wiederauferstandener Ronan oder Loki von Asgard.

Von den Filmschauspielern wird jedoch niemand an der Animationsserie mitwirken. Die Charaktere werden gesprochen von: Will Friedle als Star-Lord, David Sobolov als Drax, Vanessa Taylor als Gamora, Kevin Michael Richardson als Groot, Trevor Devall als Rocket Raccoon und James Arnold Taylor als Yondu und Cosmo.

Die Anime-Serie wird ab dem 26. September auf Disney XD zu sehen sein. Hier ein erster Eindruck in Form eines Teaser-Trailers.